Lancet Oncol:肾透明细胞腺癌与肥胖悖论相关的转录组特征分析

2021-12-13 04:33:27 来源:
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一.统计数据分析背景

肥大与大肠半透明巨噬细胞恶性肿瘤 (ccRCC)的高风险降低有关,但肥大又分歧地与该的肾功能改善有关,其潜在程序尚不确切。现作者对肥大病人和短时间增重病人在原发和瘤周碳水化合物两组织当中的心肌转换成和免疫磷酸化两组差异性透过统计数据分析持续性。

本文介绍了基因所列达引起的微环境的差异性有助于断言肥大病人的生存环境优势(肥大假设)。

二.持续性流程三.评论介绍1.COMPARZ缓冲区、TCGA-KIRC缓冲区、MSK免疫外科手法术缓冲区统计数据收集、矫正

在COMPARZ缓冲区的453名病人当中,有375名(83%)病人较强可用的微阵列统计数据,外科手法术前BMI精确测量以及无十分困难和相非常生存环境统计数据透过持续性(所列1)。除119名(26%)增重病人外,来自COMPARZ实验的最后缓冲区有数256名(68%)病人(n=256)。

所列1.COMPARZ临床实验缓冲区的人口比则有数据分析和临床外观上

TCGA-KIRC缓冲区当中的332则有病人当中,评估了经大肠切除法术外科手法术的152则有(46%)中叶(即AJCC III和IV期)ccRCC病人的临床和人口比则有数据分析统计数据(所列2)。在排除59名(39%)增重病人后,最后获得的缓冲区有数93名病人(n=93)。

所列2.中叶半透明巨噬细胞大肠巨噬细胞恶性肿瘤TCGA-KIRC缓冲区的人口比则有学和临床外观上

从62则有MSK周遭碳水化合物两组织缓冲区当中透过大肠脏切除法术的非转移性半透明巨噬细胞RCC病人当中获得了原发性和周遭碳水化合物样品。在这个缓冲区当中,从59名病人的PNN(大肠周附近)周遭碳水化合物,25名病人的PNA(远离大肠周)周遭碳水化合物以及55名病人的两组织当中取样。在排除增重病人后来,最后缓冲区有数41名(69%)PNN样本病人, PNA样本为17(68%),样本为37(67%)。从在此之后的203名旁观者的MSK免疫外科手法术统计数据分析人群集当中排除74名(36%)增重病人后,总生存环境持续性的最后缓冲区有数129名(64%)旁观者(所列3)(n=129)。

所列3. 采用MSK免疫外科手法术的临床实验缓冲区的人口比则有数据分析和临床外观上

2.肥大的大肠半透明巨噬细胞恶性肿瘤病人一般来说短时间增重的大肠半透明巨噬细胞恶性肿瘤病人总生存环境期变长

根据KM生存环境持续性,在三两组当中都发现肥大病人的总生存环境期变长。在TCGA-KIRC缓冲区当中,经分期录入后,肥大病人的相非常存活期工于短时间增重两组;在COMPARZ缓冲区当中,经IMDC高风险分数录入后,胖病人的相非常存活期也工于短时间增重两组。在MSK免疫疗法缓冲区当中,经IMDC高风险分数录入后,BMI与死亡率的无突出差异性(如绘出1)。

绘出1.TCGA-KIRC缓冲区 (A)、COMPARZ 缓冲区(B)和MSK免疫外科手法术缓冲区(C)的总生存环境期

3.COMPARZ缓冲区当中肥大病人较强更快的PFS

对CPMPARZ缓冲区KM持续性后,KM斜率表明,COMPARZ缓冲区当中肥大病人比短时间增重病人较强更快的PFS。

绘出S1.COMPARZ缓冲区当中肥大病人比短时间增重病人较强更快的PFS

4.常用一线口服外科手法术,肥大病人仍较强更快的OS

KM斜率表明了在常用一线过氧化物腺苷抑制剂(pazopanib或Sunitinib)的两个外科手法术两组当中,肥大病人的OS一直较短时间增重病人好。

绘出S2.COMPARZ缓冲区常用一线口服外科手法术两组的总生存环境期持续性

5.COMPARZ缓冲区当中,肥大与短时间增重的病人磷酸化两组基因外观上存有突出差异性

做到完上述持续性,作者在三个缓冲区当中确认肥大假设存有后来,接下来在COMPARZ缓冲区当中对肥大和短时间增重病人评估了磷酸化两组学差异性。先是做到了Hallmark基因集的GSEA持续性,非常肥大病人与短时间增重病人二者之间的差异性:肥大病人当中表明诱发、TGF-β、表皮-间充质演进和心肌转换成频率通路突出调低,提示伤口愈合间接地的过氧化物(绘出A)。绘出B是对绘出A择优的几个基因所列达通路的Enrichment plots。

绘出S4.COMPARZ缓冲区当中肥大病人与短时间增重病人的ccRCC磷酸化两组基因外观上存有突出差异性

6.COMPARZ缓冲区与TCGA-KIRC缓冲区 当中肥大比短时间增重病人的心肌转换成分数高

在GESA衍生的外观上基因集心肌转换成分数非常当中,肥大病人优于短时间增重病人(如绘出2)。

绘出2.COMPARZ缓冲区(A)与TCGA-KIRC缓冲区 (B)当中肥大原发病人与短时间增重病人的心肌转换成的z score

7.短时间增重与肥大病人的免疫巨噬细胞群集无突出差异性

对短时间增重(7则有)与肥大(16则有)病人的原发的主要免疫巨噬细胞存量之外采用流式巨噬细胞法术透过评估。绘出A表明了肥大病人与短时间病人二者之间的免疫巨噬细胞群集的相非常差异性。绘出B确切表明了肥大和短时间增重病人T巨噬细胞群集的常为水平。发现短时间增重与肥大病人的免疫巨噬细胞群集无相比差异性,免疫巨噬细胞常为的层面与BMI无关。

绘出S9.用流式巨噬细胞法术持续性短时间增重与肥大病人的免疫巨噬细胞群集无相比差异性

8.与短时间增重病人远比,肥大病人瘤周碳水化合物两组织水肿降低,尤其是附近的瘤周碳水化合物

在MSK的非转移性ccRCC病人的前瞻性缓冲区当中,作者合并了20个最突出的丰富的IPA规范通路,这些通路来自于肥大和短时间增重病人的PNN和PNA样本的非常(绘出A)。肥大和短时间增重病人的PNN和PNA样本二者之间的免疫常为(ssGSEA分数)非常(绘出B)。

绘出S5.与短时间增重的病人远比,肥大病人的大肠周碳水化合物表明出水肿和诱发降低

综上,在COMPARZ实验缓冲区当中,经过IMDC高风险分数调整后,发现一般来说短时间增重病人,过氧化物腺苷抑制剂外科手法术提高了肥大病人的成功率,同样是接受sunitinib外科手法术的病人。IMDC高风险分数模型包含的两组分间接说明了宿主环境因素对前列腺恶性肿瘤持续性水肿发挥作用(则有如贫血,惰性粒巨噬细胞增多,和血小板增多症),这些环境因素或许也是免疫外科手法术结果和BMI二者之间关连程序的原因。发现肥大病人的心肌转换成分数优于短时间增重病人,与之前其他的统计数据分析结果所列明的,参与心肌转换成,β-硫酸间接地等等基因的富集的现象一致。因此,心肌转换成的差异性可以以外断言肥大病人接受过氧化物腺苷抑制剂外科手法术后的较好肾功能。

此统计数据分析为肥大假设提供者了药理学支持。在患有ccRCC的病人观察到肥大病人一般来说短时间增重的病人微环境的差异性:同样是肥大病人的的心肌转换成降低,但相非常水肿无相比差异性。没人一提的是的是肥大病人的周遭碳水化合物表明降低的水肿和诱发状况。半透明巨噬细胞恶性肿瘤与瘤周碳水化合物两组织微环境的复杂交互发挥作用或许较强临床意义,没人进一步统计数据分析。

原始出处:

Sanchez A, Furberg H, Kuo F, Vuong L, Ged Y, Patil S, Ostrovnaya I, Petruzella S, Reising A, Patel P, Mano R, Coleman J, Russo P, Liu CH, Dannenberg AJ, Chan TA, Motzer R, Voss MH, Hakimi AA. Transcriptomic signatures related to the obesity paradox in patients with clear cell renal cell carcinoma: a cohort study.Lancet Oncol. 2020 Feb;21(2):283-293

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