由于在实验室先决条件下培养动物体的挑战,至今为止,人类肠胃动物体小组中许多种群的原核动物序列仍然推断出。
为了解决这个问题,分析人员从来自水文和环境因素多样化的人类受试者的3,810个粪弘原核动物中重建了60,664个原核动物原核动物。这些原核动物为2,058个以前推断出的种群级操作分类单位(OTU)提供参考点,使得测序肠胃细菌的系统发育多样性上升50%。
平均而言,重新OTU占每个人珍贵度的33%和种群丰度的28%,并且非常珍贵来自小村人口的人类。
临床肠胃动物体小组分析的荟萃分析确切了新OTU的多种性疾病关联,这些关联无论如何优化预测模型。
最后,分析人员的分析显示,未培养的肠胃种群经历了原核动物减少而夺去了某些动物合成途径,这可能为将来优化种植策略肇事者。
更早出处:
Nayfach S et al. Novel insights from uncultivated genomes of the global human gut microbiome. NATURE, 2019; doi: 10.1038/s41586-019-1058-x.
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